حرم حضرت ابوالفضل(ع) یك گنبد و دو مناره دارد. قطر گنبد دوازده متر به صورت نیم كروی با نوك تیز و ساقه ای بلند است كه از آن پنجره هایی با قوس‌های كمانی به بیرون گشوده می‌شود. ارتفاع آن ۳۹ متر است و نمای داخلی و بیرونی آن به صورتی زیبا تزیین شده است.
در نمای داخلی آیه هایی از قرآن كریم در میان كاشی‌های زیبا به رنگ سفید و به خط ثلث به چشم می‌خورد. تاریخ كاشی كاری، بر اساس كتیبه آن، ۱۳۰۵ ق است. این كار را امین الدوله صدر اصفهانی انجام داده است.
در ۱۳۷۵ ق، نمای بیرونی گنبد با روكشی از طلا تزیین شد. این كار با تلاش مدیر اوقاف كربلا انجام یافت و در مجموع ۶۴۱۸ خشت طلا در آن به كار رفت.
در قسمت پایین گنبد در نمای بیرونی، آیه هایی از قرآن همراه با آینه و طلاكاری نقش بسته است.
